MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 11449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018676	TAC	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
2	NC_018676	GT	3	6	42	47	0 %	50 %	50 %	0 %	407681355
3	NC_018676	TAC	2	6	102	107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
4	NC_018676	TGA	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
5	NC_018676	ATG	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
6	NC_018676	A	8	8	360	367	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
7	NC_018676	A	7	7	370	376	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
8	NC_018676	CAG	2	6	377	382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
9	NC_018676	ATT	2	6	386	391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681355
10	NC_018676	A	6	6	398	403	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
11	NC_018676	TAA	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
12	NC_018676	CTA	2	6	458	463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
13	NC_018676	TAAT	2	8	503	510	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
14	NC_018676	GCT	3	9	520	528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681355
15	NC_018676	A	7	7	562	568	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
16	NC_018676	GGT	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
17	NC_018676	AT	3	6	602	607	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
18	NC_018676	T	6	6	675	680	0 %	100 %	0 %	0 %	407681355
19	NC_018676	AGG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681355
20	NC_018676	AGA	2	6	687	692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
21	NC_018676	TAA	2	6	707	712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
22	NC_018676	TA	3	6	715	720	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
23	NC_018676	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
24	NC_018676	CAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681355
25	NC_018676	TA	3	6	853	858	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
26	NC_018676	CTG	2	6	860	865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681355
27	NC_018676	TAA	2	6	935	940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
28	NC_018676	A	6	6	961	966	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
29	NC_018676	ACT	2	6	988	993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
30	NC_018676	GAT	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
31	NC_018676	ATA	2	6	1009	1014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
32	NC_018676	GGT	2	6	1021	1026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
33	NC_018676	A	8	8	1049	1056	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
34	NC_018676	T	6	6	1066	1071	0 %	100 %	0 %	0 %	407681355
35	NC_018676	AAG	2	6	1076	1081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
36	NC_018676	AGG	2	6	1134	1139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681355
37	NC_018676	GGT	2	6	1213	1218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
38	NC_018676	A	7	7	1238	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
39	NC_018676	TAC	2	6	1245	1250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
40	NC_018676	CTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681355
41	NC_018676	A	7	7	1261	1267	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
42	NC_018676	T	6	6	1274	1279	0 %	100 %	0 %	0 %	407681355
43	NC_018676	CAG	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407681355
44	NC_018676	GAAA	2	8	1330	1337	75 %	0 %	25 %	0 %	407681355
45	NC_018676	A	7	7	1335	1341	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
46	NC_018676	AAAT	2	8	1350	1357	75 %	25 %	0 %	0 %	407681355
47	NC_018676	TTTGA	2	10	1369	1378	20 %	60 %	20 %	0 %	407681355
48	NC_018676	CTC	2	6	1394	1399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407681355
49	NC_018676	TAA	2	6	1496	1501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
50	NC_018676	GGT	2	6	1513	1518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407681355
51	NC_018676	AGA	2	6	1524	1529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
52	NC_018676	AAAT	2	8	1532	1539	75 %	25 %	0 %	0 %	407681355
53	NC_018676	GAT	2	6	1542	1547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
54	NC_018676	AGA	3	9	1569	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
55	NC_018676	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
56	NC_018676	GAA	2	6	1588	1593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
57	NC_018676	A	6	6	1659	1664	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
58	NC_018676	A	7	7	1673	1679	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
59	NC_018676	TAAT	2	8	1694	1701	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
60	NC_018676	TGA	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681355
61	NC_018676	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
62	NC_018676	TAA	2	6	1755	1760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
63	NC_018676	GAA	2	6	1768	1773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
64	NC_018676	AT	3	6	1783	1788	50 %	50 %	0 %	0 %	407681355
65	NC_018676	A	6	6	1790	1795	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
66	NC_018676	A	8	8	1805	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
67	NC_018676	A	7	7	1841	1847	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
68	NC_018676	TCT	2	6	1858	1863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407681355
69	NC_018676	A	6	6	1867	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	407681355
70	NC_018676	TGT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407681355
71	NC_018676	GAA	2	6	1900	1905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407681355
72	NC_018676	TAA	3	9	1908	1916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681355
73	NC_018676	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681356
74	NC_018676	TAA	2	6	1977	1982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
75	NC_018676	CTG	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681356
76	NC_018676	A	7	7	2004	2010	100 %	0 %	0 %	0 %	407681356
77	NC_018676	ATC	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407681356
78	NC_018676	TC	3	6	2109	2114	0 %	50 %	0 %	50 %	407681356
79	NC_018676	A	6	6	2123	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	407681356
80	NC_018676	CA	3	6	2173	2178	50 %	0 %	0 %	50 %	407681356
81	NC_018676	AAT	2	6	2179	2184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
82	NC_018676	TAA	2	6	2241	2246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407681356
83	NC_018676	CAA	4	12	2247	2258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681356
84	NC_018676	T	8	8	2457	2464	0 %	100 %	0 %	0 %	407681356
85	NC_018676	ACA	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407681356
86	NC_018676	TGC	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407681356
87	NC_018676	AGG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407681356
88	NC_018676	TAAAGG	2	12	2850	2861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	407681356
89	NC_018676	GTA	2	6	2876	2881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407681356
90	NC_018676	ATT	2	6	2952	2957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407681356
91	NC_018676	T	6	6	2995	3000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018676	TGT	2	6	3004	3009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018676	TATT	2	8	3023	3030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018676	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018676	GTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018676	T	8	8	3104	3111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018676	T	6	6	3115	3120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018676	T	9	9	3122	3130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018676	T	7	7	3150	3156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018676	TTA	3	9	3161	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018676	GTT	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018676	T	7	7	3191	3197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018676	TTATT	2	10	3203	3212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018676	TGTTT	2	10	3222	3231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018676	TTTTG	2	10	3247	3256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018676	TGTA	2	8	3267	3274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018676	TGT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018676	AGTA	2	8	3294	3301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018676	AGT	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018676	ATA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018676	ATG	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018676	T	6	6	3367	3372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018676	TGT	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018676	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018676	TAAT	2	8	3422	3429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018676	A	8	8	3430	3437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018676	AT	4	8	3447	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018676	GTTT	2	8	3496	3503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018676	GGTT	2	8	3517	3524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018676	TATT	2	8	3536	3543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018676	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018676	TTTA	2	8	3583	3590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018676	TAT	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018676	TTA	2	6	3651	3656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018676	TAAAA	2	10	3710	3719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018676	GTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018676	CTGTTG	4	24	3743	3766	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_018676	A	7	7	3786	3792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018676	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018676	TTA	3	9	3823	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018676	T	6	6	3848	3853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018676	GTT	2	6	3862	3867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018676	TAAAG	2	10	3880	3889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018676	GTA	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018676	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018676	TAT	2	6	3927	3932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018676	T	7	7	3939	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018676	TAA	3	9	3952	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018676	AAC	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018676	CAA	2	6	3983	3988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_018676	ACAAA	2	10	3989	3998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018676	TAA	2	6	4025	4030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018676	ACA	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_018676	AAC	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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154	NC_018676	A	8	8	4301	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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